Quay lại 3 năm trước, ngày 24/9/2014 cơ quan điều tra khởi tố bắt giam Nguyễn Minh Hùng TGĐ cty VN Pharma ( cty có sự tham gia của người thân Bà Nguyễn Thị Kim Tiến) về tội buôn lậu thuốc tân dược. Ngày 25/9/2014 trong thảo luận tại phiên họp do Uỷ ban các vấn đề XH của QH, đại biểu Phong Lan đã mạnh mẽ chỉ trích BYT về công tác đấu thầu, nhập khẩu thuốc , thuốc giả và một số vấn đề bất cập, yếu kém thuộc ngành Y tế.
Thay vì tiếp thu cầu thị, Chánh VP BYT thừa lệnh Bộ trưởng ” ngạo mạn ” ký công văn đề nghị UBND TP.HCM chỉ đạo Sở Y tế giải trình liên quan đến phát biểu của đại biểu Quốc hội Phạm Khánh Phong Lan (Phó Giám đốc Sở Y tế TP), cho rằng ĐB Phong Lan phát biểu với tư cách cá nhân công chức y tế. ( Mặc dầu cả bà BT Kim Tiến lẫn PGS Phong Lan cùng là đại biểu QH đoàn Tp HCM ). 
Ngày đó công luận xôn xao, các ĐBQH, có cả các Uỷ viên UBTV QH cũng lên tiếng đứng về phía chị Phong Lan, cho rằng BYT đã sai, vượt quá thẩm quyền.
GS Nguyễn Minh Thuyết, Đại biểu Quốc hội (ĐBQH) khóa XI, XII, nguyên Phó Chủ nhiệm Ủy ban Văn hóa, giáo dục, thanh niên, thiếu niên và nhi đồng của Quốc hội đã nói :
“Cách giải quyết đúng nhất là Bộ trưởng Bộ Y tế Nguyễn Thị Kim Tiến cho thu hồi công văn đã phát, đồng thời công khai giải trình và xin lỗi đại biểu Phạm Khánh Phong Lan”. Sau đó, BYT ” lặn ” luôn. 
Chiều 19/11/2015 Quốc hội thảo luận tại tổ về Luật Dược sửa đổi. Người dân đang mong đợi luật này ra đời sẽ quản lý tốt hơn về giá thuốc, chất lượng thuốc bảo đảm hơn. Thảo luận về luật này, ĐB Phạm Khánh Phong Lan phát biểu ” Xây dựng Luật phải lấy lợi ích của nhân dân làm chính “. Quay sang phía đại biểu Kim Tiến :
“Về chất lượng thuốc, là người trong ngành nhưng xin lỗi ngành y tế (Bộ trưởng Bộ Y tế Nguyễn Thị Kim Tiến có mặt ở buổi thảo luận) chúng tôi rất quan ngại”.
Trên diễn đàn QH, chị luôn là người chất vấn bám sát vấn đề, không nề hà tranh luận, phản biện.
Chị là người khẳng định H- Capita của vụ cty VN Pharma là thuốc giả và tội danh của Nguyễn Minh Hùng và đồng bọn là buôn thuốc giả, có khung hình phạt lên đến chung thân hoặc tử hình. Chị bức xúc : ” Buôn bán kinh doanh thuốc giả là tội ác giết người hàng loạt ! “.
Chị Phong Lan cũng nói thẳng ” Tôi nghi ngờ có sự bao che. Trách nhiệm vụ VN Pharma thuộc về Bộ Y tế ! “. Người ta phải bao che, họ sợ Hùng sẽ là một ” Xiêng Phênh ” khi hắn phải nhận án..tử (?)